普通光學(xué)顯微鏡使用的鹵素?zé)艄庠礊榛旌瞎�，光譜范圍寬，成象時(shí)樣品上每個(gè)照光點(diǎn)均會(huì)受到色差影響以及由照射光引起的散射和衍射的干擾，影響成象質(zhì)量。

    lscm結(jié)構(gòu)上采用雙針 孔（pinhole）裝置，形成物象共軛的獨(dú)特設(shè)計(jì)，激光經(jīng)物鏡焦平面上針 孔形成點(diǎn)光源對(duì)樣品掃描，于測(cè)量透鏡焦平面的探測(cè)針 孔處經(jīng)空間濾波后，有效地抑制同焦平面上非測(cè)量光點(diǎn)形成的雜散熒光和樣品不同焦平面發(fā)射來(lái)的干擾熒光。這是因?yàn)楣鈱W(xué)系統(tǒng)物象共軛，只有物鏡焦平面上的點(diǎn)經(jīng)針 孔空間濾波才能形成光點(diǎn)圖象，掃描后可得到信噪比極高的光學(xué)橫斷面，分辨率比普通光學(xué)顯微鏡提高1.4倍。

    lscm的光源為激光，單色性好，基本消色差，成象聚焦后焦深小，縱向分辨率高，可無(wú)損傷地對(duì)樣品作不同深度的層掃描和熒光強(qiáng)度測(cè)量，不同焦平面的光學(xué)切片經(jīng)三維重建后能得到樣品的三維立體結(jié)構(gòu)，這種功能被形象的稱為"顯微ct"。