現(xiàn)今的數(shù)碼顯微鏡市場(chǎng)百花齊放，約在四百年前眼鏡片工匠們開始創(chuàng)制放大鏡，當(dāng)時(shí)的放大鏡倍數(shù)只有3-5倍。但是這種原始的嘗試已將人類的視力引向了微觀世界的廣闊領(lǐng)域。由此人們開始探索物質(zhì)世界的微細(xì)構(gòu)造。在這種欲望下，人類從簡(jiǎn)單的單透鏡學(xué)會(huì)組裝透鏡具組，甚至學(xué)會(huì)透鏡具組，棱鏡具組的綜合使用。就這樣最原初的顯微鏡創(chuàng)造出來(lái)了。這類工具促進(jìn)了幾何光學(xué)，變換光學(xué)和光諧學(xué)的理論知識(shí)的進(jìn)展。在實(shí)踐中，霍克，列文虎克，馬爾辟基，格拉夫已用放大數(shù)百倍的顯微鏡發(fā)現(xiàn)了植物細(xì)胞，動(dòng)物的精子，紅細(xì)胞，胃，肺的組織結(jié)構(gòu)，以及卵泡的發(fā)育過(guò)程。 

7世紀(jì)末葉到18世紀(jì)初葉荷蘭物理學(xué)家惠更斯為顯微鏡的發(fā)展做出了接觸的貢獻(xiàn)。目前市場(chǎng)出售的惠更斯目鏡就是現(xiàn)代多種目鏡的原型。這時(shí)的光學(xué)顯微鏡已初具現(xiàn)代顯微鏡的基本結(jié)構(gòu)。 

19世紀(jì)末德國(guó)學(xué)者阿貝奠定了光學(xué)顯微鏡的成像原理。從此能夠制造和使用油沁系物鏡使光學(xué)顯微鏡的分辨本領(lǐng)已達(dá)到最高極限。 

由于觀察手段的進(jìn)步，在動(dòng)物組織，植物組織和細(xì)菌學(xué)等領(lǐng)域里出現(xiàn)了許多重大的發(fā)展。最終導(dǎo)致被恩格斯譽(yù)為19世紀(jì)最偉大的三大發(fā)現(xiàn)之一的細(xì)胞學(xué)說(shuō)被德國(guó)學(xué)者施旺和施萊登所奠定。這就是說(shuō)，促使醫(yī)學(xué)，生物學(xué)進(jìn)入新的細(xì)胞水平的基礎(chǔ)學(xué)科-細(xì)胞學(xué)的最基本手段就是這種光學(xué)顯微鏡。 

20世紀(jì)中葉制造的以短波長(zhǎng)，高能量的光線做光源的熒光顯微鏡和紫外光顯微鏡的基本機(jī)構(gòu)仍是傳統(tǒng)顯微鏡。只是由于光源的波長(zhǎng)的縮短而提高了顯微鏡的分辨本領(lǐng)。沿著這個(gè)方向的革命性進(jìn)展應(yīng)算電子顯微鏡的出現(xiàn)。其實(shí)電子顯微鏡的基本結(jié)構(gòu)原理仍與光學(xué)顯微鏡相同。只是他的光源是高能電子束，從而聚光鏡和透鏡是強(qiáng)大的電磁感應(yīng)圈。 

從前人類的視力借助于光學(xué)顯微鏡能分辨相距萬(wàn)分之三毫米((3X10'mm)的兩個(gè)質(zhì)點(diǎn)的話，那么應(yīng)用電子顯微鏡已能分辨出相距一千萬(wàn)分之一毫米((1X1。一’mm)的兩個(gè)質(zhì)點(diǎn)。如果說(shuō)19世紀(jì)20年代人們已清楚地觀察過(guò)動(dòng)植物細(xì)胞的微細(xì)結(jié)構(gòu)，已確認(rèn)細(xì)胞里面的核、核仁、線粒體、高爾基器、中心體、吞噬泡等細(xì)胞小器官和細(xì)胞里的各種包涵體、色素顆粒及寄生物的話，那么20世紀(jì)50年代已經(jīng)能辨認(rèn)組成這些小器官的各類膜系統(tǒng)，甚至能辨認(rèn)組成膜系統(tǒng)的分子層次及酶蛋白質(zhì)亞基結(jié)構(gòu)了�？傊�能辨認(rèn)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)甚至可以說(shuō)超微結(jié)構(gòu)。 

顯徽鏡結(jié)構(gòu)的發(fā)展同日益進(jìn)展的處理細(xì)胞結(jié)構(gòu)的固定劑、染色技術(shù)相互補(bǔ)充著，給予現(xiàn)代醫(yī)學(xué)、生物學(xué)開拓著日益廣闊的發(fā)展前景。尤其核酸和蛋白質(zhì)的化學(xué)分析技術(shù)的進(jìn)展配合顯徽鏡技術(shù)的發(fā)展，將人類視力已引向分子生物學(xué)、分子細(xì)胞學(xué)、分子免疫學(xué)和分子遺傳學(xué)的領(lǐng)域里了。 

電子顯微鏡已被分子生物學(xué)家當(dāng)作一種強(qiáng)有力的研究手段而廣泛應(yīng)用。但是電子顯微鏡只適用于細(xì)胞死后的形態(tài)學(xué)觀察�；罴�(xì)胞的增殖、分化、細(xì)胞的能量代謝、細(xì)胞游走運(yùn)動(dòng)、吞噬活動(dòng)等動(dòng)態(tài)觀察，仍需先進(jìn)的染色技術(shù)和光學(xué)顯微鏡技術(shù)。