哈工大突破高通量超分辨顯微成像難題
提出基于計算光學(xué)成像的新一代高通量三維動態(tài)超分辨率成像方法,通過計算成像技術(shù)增強(qiáng)熒光漲落探測靈敏度,使探測靈敏度提升兩個數(shù)量級以上,突破了現(xiàn)有顯微成像技術(shù)在高通量視場、高空間分辨率和高時間分辨率等難以兼顧的難題。
高通量成像——大視場細(xì)胞骨架微管成像 研究團(tuán)隊將SACD方法應(yīng)用于轉(zhuǎn)盤共焦(Spinning Disk Confocal,SDC)系統(tǒng),實現(xiàn)了對毫米級(2毫米×1.4毫米)視場內(nèi)微管的高通量超分辨成像,包含多達(dá)2000個細(xì)胞。傳統(tǒng)SOFI需要幾乎半天的連續(xù)采樣才能對整塊區(qū)域完成重建,而SACD只需10分鐘便可達(dá)到更加優(yōu)越的成像性能。在任意區(qū)域中,SACD都保持了極高的分辨率,能夠清晰地分辨鄰近的微管結(jié)構(gòu),解析出轉(zhuǎn)盤共焦顯微系統(tǒng)無法得到的高頻信息。 活細(xì)胞長時程成像——活細(xì)胞線粒體外膜動態(tài)成像 為了克服低信噪比與長時程的活細(xì)胞成像條件,李浩宇團(tuán)隊在SACD的基礎(chǔ)上引入了之前開發(fā)的稀疏解卷積技術(shù)(該團(tuán)隊于去年發(fā)表在《自然生物技術(shù)》期刊上,Weisong Zhao et al.,Nature Biotechnology,40,606–617,2022)。Sparse-SACD使快速而復(fù)雜的細(xì)胞器動態(tài)過程得以可視化,實現(xiàn)在超過10分鐘的時間內(nèi)對COS-7活細(xì)胞線粒體進(jìn)行快速動態(tài)成像。得益于該技術(shù)的高通量與穩(wěn)定性,線粒體被解析為中空的膜狀細(xì)胞器,整個細(xì)胞中線粒體的裂變和融合過程都被清晰地記錄下來。 最后,研究者使用SACD技術(shù)進(jìn)行了全活細(xì)胞四維超分辨成像,即在超過10分鐘時間(成像溫度37°C)內(nèi)對COS-7活細(xì)胞的線粒體外膜網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行三維超分辨體成像(下圖)。與傳統(tǒng)共焦系統(tǒng)相比,精細(xì)結(jié)構(gòu)的可見性得到了根本性提高,線粒體被清晰地成像為銳利的中空膜結(jié)構(gòu)。通過稀疏性和連續(xù)性的雙重約束,SACD高保真地實現(xiàn)了隨時間變化的全細(xì)胞線粒體裂變與融合成像。 圖為活體四維超分辨成像。轉(zhuǎn)盤共焦顯微鏡(SD-confocal,左)和Sparse-SACD(右)在37°C下對Skylan-S-TOM20標(biāo)記的活COS-7細(xì)胞進(jìn)行四維成像。比例尺:5微米。 形象地說,分布在熒光背景中的單個分子波動信號就像“迷霧中閃爍的星星”,SACD在計算統(tǒng)計量之前盡可能地消除了這種“迷霧”,以便在真實的生理環(huán)境下實現(xiàn)高質(zhì)量的超分辨成像。通過充分利用原始圖像中的熒光漲落信息,SACD打破了現(xiàn)有超分辨技術(shù)的通量限制以及需要特殊光學(xué)控制的設(shè)備限制,同時還能夠直接應(yīng)用于現(xiàn)有商業(yè)化共焦熒光顯微鏡系統(tǒng)(或其他任何熒光系統(tǒng))中,有助于低成本、高通量地進(jìn)行相關(guān)生物醫(yī)學(xué)研究,有望成為生物學(xué)家分析細(xì)胞結(jié)構(gòu)和瞬態(tài)動力學(xué)的常規(guī)儀器。 值得一提的是,SOFI技術(shù)的發(fā)明者、德國喬治-奧古斯都-哥廷根大學(xué)教授安德雷恩(J.Enderlein)是該工作的審稿人之一。安德雷恩教授表示:“在漲落分析之前進(jìn)行預(yù)解卷積的想法很新穎,非常合理,因為這應(yīng)該是消除虛假漲落的好方法”“使用這種技術(shù)呈現(xiàn)的圖像質(zhì)量非常好”“我認(rèn)為所提出的方法會是更優(yōu)的”。 哈工大李浩宇教授和北京大學(xué)陳良怡教授為論文的通訊作者;哈工大助理教授趙唯淞為論文的第一作者,論文共同第一作者還包括北京大學(xué)趙士群副研究員、哈工大博士研究生韓鎮(zhèn)謙和丁相妍,論文的共同通訊作者還包括哈工大丁旭旻教授和北京大學(xué)郭長亮副研究員。哈工大譚久彬院士為論文共同作者和哈工大科研團(tuán)隊負(fù)責(zé)人。該項研究成果主要由哈工大儀器學(xué)院和北京大學(xué)未來技術(shù)學(xué)院合作完成,哈工大為論文第一通訊單位。 原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41566-023-01234-9 |
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