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蘇州醫(yī)工所微小模式生物流式成像研究取得進(jìn)展

發(fā)布:cyqdesign 2018-01-16 12:15 閱讀:1660
模式生物是生命科學(xué)研究中的理想研究材料,生命科學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展依賴于模式動(dòng)物資源的開發(fā)與利用,以斑馬魚、線蟲、渦蟲等為代表的微小模式動(dòng)物,在基于生命體活體表征的疾病模型藥物篩選中發(fā)揮著越來越重要的作用。然而,目前在利用微小型模式動(dòng)物開展科學(xué)研究過程中主要以手工分揀篩選和利用傳統(tǒng)顯微鏡進(jìn)行局部成像為主,不僅工作量大而且數(shù)據(jù)采集效率低下,無法實(shí)現(xiàn)大規(guī)模實(shí)時(shí)分析,無法有效發(fā)揮微小模式動(dòng)物的自身優(yōu)勢(shì),更無法適應(yīng)中大規(guī)模遺傳/藥物篩選需求。因此,生命科學(xué)領(lǐng)域需要一套基于大顆粒成像的流式分析與分選系統(tǒng),來進(jìn)行高效率的微小模式生物的成像及分選!  /a?qtRw  
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在中國(guó)科學(xué)院儀器裝備研制項(xiàng)目的支持下,由中科院上海生命科學(xué)研究院潘巍峻研究員提出需求和應(yīng)用方向,中科院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所李輝課題組開發(fā)了一套針對(duì)斑馬魚等微小模式動(dòng)物高速成像及分選系統(tǒng)。類似于流式細(xì)胞儀對(duì)細(xì)胞進(jìn)行檢測(cè)與成像,該系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)對(duì)100微米~2mm的微小模式生物流過微流道時(shí)的高通量自動(dòng)成像。系統(tǒng)采用片層光照明和高速的線陣CCD相機(jī),成像速度可以達(dá)到每秒10到15胚胎,比國(guó)外類似成像設(shè)備成像速度提高10倍以上。 "r[Ob]/  
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針對(duì)采集到的大量斑馬魚胚胎圖像,該研究進(jìn)一步開發(fā)了圖像分割及識(shí)別的軟件算法?梢允褂米詣(dòng)識(shí)別出未破膜的斑馬魚胚胎和已破膜的斑馬魚胚胎,并可根據(jù)識(shí)別的結(jié)構(gòu)自動(dòng)進(jìn)行胚胎死亡/存活的判讀,以及胚胎形態(tài)特征的自動(dòng)分析。 #dDM "s  
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該設(shè)備的開發(fā)將滿足并推動(dòng)微小型模式動(dòng)物在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的大規(guī)模應(yīng)用,加速相關(guān)領(lǐng)域研究進(jìn)展和基于表型篩選的新型藥物研發(fā)進(jìn)程。相關(guān)工作發(fā)表在Biomedical Optics Express上。       6o<(,\ad [  
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圖1.寬場(chǎng)成像系統(tǒng)原理圖,圖a是光片的形成和線陣CCD成像示意圖,圖b是按照時(shí)間序列將一維數(shù)據(jù)拼接成二維的圖像。
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圖2.野生型斑馬魚胚胎高速流式成像結(jié)果圖,圖a是原圖,圖b是將圖a進(jìn)行減背景操作所得。
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圖3.對(duì)未破膜的斑馬魚胚胎進(jìn)行識(shí)別和分割圖,(a-c)野生型斑馬魚胚胎在不同發(fā)育時(shí)期的成像結(jié)果圖,分別是:3h,13h和21.5h。(d-f)分別是野生型斑馬魚胚胎的卵黃囊、頭部和尾部的細(xì)節(jié)發(fā)育圖。(a-c)中的標(biāo)尺長(zhǎng)度是1mm,(d-f)中的標(biāo)尺長(zhǎng)度是0.3mm。
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圖4.對(duì)正常發(fā)育的去膜斑馬魚胚胎(72 hpf)的形態(tài)特征統(tǒng)計(jì)結(jié)果,EL:胚體的最大線性長(zhǎng)度,EW:胚胎的最大線性寬度。可以看出斑馬魚胚胎的線性長(zhǎng)度呈高斯?fàn)罘植,而大多?shù)胚體的最大線性寬度是0.5mm。
關(guān)鍵詞: 成像CCD
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