納米孔測序聯(lián)合光學(xué)測繪揭示轉(zhuǎn)基因植物細節(jié)
索爾克的研究人員繪制了具有最高分辨率的轉(zhuǎn)基因植物系基因組和表觀基因組圖,為了精確地揭示插入一段外源DNA后,在分子水平上會發(fā)生什么。他們的研究結(jié)果發(fā)表在2019年1月15日的PLOS Genetics,闡明了用于修飾植物的常規(guī)方法,并為更有效地減少潛在的非目標效應(yīng)提供了新思路。 “這真是一個起點,表明利用最新的繪圖和測序技術(shù)來研究插入基因后的植物基因組有何變化,”霍華德醫(yī)學(xué)研究所研究員、索爾克植物分子和細胞生物學(xué)實驗室教授、基因組分析主管Joseph Ecker說。 為了基礎(chǔ)研究或促進糧食作物健康和營養(yǎng),當科學(xué)家想把一個新基因插入植物中時,他們通常依靠農(nóng)桿菌來完成這項任務(wù)。農(nóng)桿菌是引起冠癭瘤的細菌。早在幾十年前,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了一顆感染細菌的樹,細菌將它的一些DNA轉(zhuǎn)移到了樹的基因組中。從那時起,研究人員就開始利用農(nóng)桿菌的這種轉(zhuǎn)移能力(轉(zhuǎn)移DNA,T-DNA)將所需基因轉(zhuǎn)移到植物中。 最近,DNA測序技術(shù)暗示,當農(nóng)桿菌T-DNA被用于植物轉(zhuǎn)基因時,它可能會對本地DNA的結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)造成額外的改變。 |