我國科學(xué)家繪制出人類細(xì)胞圖譜
世界首個(gè)人類細(xì)胞圖譜日前在浙江大學(xué)繪制成功。3月26日,國際頂級(jí)期刊《自然》在線刊登了浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭國驥教授團(tuán)隊(duì)的這項(xiàng)最新研究成果。
細(xì)胞是生命的基本單位。在過去的數(shù)百年時(shí)間里,科學(xué)家主要利用顯微鏡和流式分析等技術(shù),依靠若干表型特征對(duì)自然界里不同物種的細(xì)胞進(jìn)行分類和鑒定。這些表型特征的選取往往引入了較多的人為主觀性。而單細(xì)胞測序技術(shù)的出現(xiàn)對(duì)這一傳統(tǒng)的細(xì)胞認(rèn)知體系帶來了革命性的變化。此前,郭國驥團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)了Microwell-seq高通量單細(xì)胞分析平臺(tái),并于2018年在國際頂級(jí)期刊《細(xì)胞》上發(fā)表了世界首個(gè)小鼠細(xì)胞圖譜。 據(jù)介紹,郭國驥團(tuán)隊(duì)對(duì)60種人體組織樣品和7種細(xì)胞培養(yǎng)樣品進(jìn)行了Microwell-seq高通量單細(xì)胞測序分析,系統(tǒng)性地繪制了跨越胚胎和成年兩個(gè)時(shí)期、涵蓋八大系統(tǒng)的人類細(xì)胞圖譜。建立了70多萬個(gè)單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,鑒定了人體100余種細(xì)胞大類和800余種細(xì)胞亞類。同時(shí),團(tuán)隊(duì)開發(fā)了scHCL單細(xì)胞比對(duì)系統(tǒng)用于人體細(xì)胞類型的識(shí)別,并搭建了人類細(xì)胞藍(lán)圖網(wǎng)站。 “這項(xiàng)工作概括地說就是人體細(xì)胞數(shù)字化。我們能用數(shù)字矩陣描述每一個(gè)細(xì)胞的特征,并對(duì)它們進(jìn)行系統(tǒng)性的分類。我們定義了許多之前未知的細(xì)胞種類,還發(fā)現(xiàn)了一些特殊的表達(dá)模式。”郭國驥說。 通過這張圖譜,團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),多種成人的上皮、內(nèi)皮和基質(zhì)細(xì)胞在組織中似乎扮演著免疫細(xì)胞的角色。郭國驥認(rèn)為,“趨化因子陽性上皮細(xì)胞、抗原呈遞陽性內(nèi)皮細(xì)胞和白介素陽性成纖維細(xì)胞廣泛地分布在成體的各種組織器官之中,并在分類上獨(dú)立于傳統(tǒng)的上皮、內(nèi)皮、基質(zhì)和免疫細(xì)胞。這些非專職的免疫細(xì)胞也在兼職干著免疫的活。我們認(rèn)為成年人非免疫細(xì)胞的廣泛免疫激活是人體區(qū)域免疫的一種重要調(diào)節(jié)機(jī)制”。 此外,通過跨時(shí)期、跨組織和跨物種的細(xì)胞圖譜分析,團(tuán)隊(duì)揭示了一個(gè)普適性的哺乳動(dòng)物細(xì)胞命運(yùn)決定機(jī)制:干細(xì)胞和祖細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)混雜且隨機(jī),而分化和成熟細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)就變得分明且穩(wěn)定,也就是說,細(xì)胞分化經(jīng)歷了一個(gè)從混亂到有序的發(fā)展過程。 該研究首次從單細(xì)胞水平上全面分析了胚胎和成年時(shí)期的人體細(xì)胞種類,研究數(shù)據(jù)將成為探索細(xì)胞命運(yùn)決定機(jī)制的資源寶庫,研究方法將對(duì)人體正常與疾病細(xì)胞狀態(tài)的鑒定帶來深遠(yuǎn)影響。在未來,臨床醫(yī)生就可能通過參照正常的細(xì)胞狀態(tài)來鑒別異常的細(xì)胞狀態(tài)和起源。 |